리서치/예규질의회신

사업부중 일부 양도 법인의 연구 및 인력개발비 세액공제 계산방법 등

서면인터넷방문상담2팀-345 (2004. 3. 2.)

종류
예규
안건번호
서면인터넷방문상담2팀-345
회신일
2004. 3. 2.
소관
국세청
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사업부 중 일부를 양도한 법인이 연구·인력개발비 세액공제(조특법 제10조)를 적용할 때, 과세연도 개시일부터 소급 4년간 발생한 연구·인력개발비 중 사업양수법인으로 이전된 것으로 보는 금액은 당시 조특령 제9조 제4항 단서에 따라 안분한다. ‍​​‌​‌​​​‌‌‌​​​회사 부문을 양도한 뒤 R&D 세액공제를 계산할 때, 합병 등 전 발생분에 각 사업연도 승계사업 매출액이 총매출액에서 차지하는 비율과 사업연도말 승계사업 자산가액이 총자산가액에서 차지하는 비율 중 큰 것을 곱한 금액을 이전분으로 보고, 나머지를 사업양도법인의 공제 대상 발생액으로 본다. ‍​​‌​‌‌​​​‌​‌‌‍​‌​​​​‌​‌‌‌​​아울러 일부 자산·종업원을 제외한 경우의 사업양수도 인정 여부, 구분경리에 의한 차감 계산, 세액공제신청서 지연제출 시 재계산 적용 여부가 함께 질의되었다.

【요지】

사업부중 일부 양도 법인의 연구 및 인력개발비 세액공제 계산방법 등

【전문】

1. 질의내용 요약

(질의 1) 조세특례제한법 제10조 의 연구 및 인력개발비 세액공제를 적용함에 있어 법인이 사업부 중 일부를 양도한 경우 당해 사업연도의 개시일부터 소급하여 4년간 발생한 연구 및 인력개발비의 계산방법에 양설이 있음

<갑 설> 사업양수법인에서 발생한 것으로 보는 연구 및 인력개발비를 제외한 금액을 사업양도법인의 연구 및 인력개발비로 함.

<을 설> 사업양도와 관계없이 각 사업연도별로 발생한 연구 및 인력개발비 전액을 사업양도법인의 연구 및 인력개발비로 함

(질의 2) 상기 질의 1)에서 갑설이 타당한 경우 사업양수도시 사업의 동질성을 훼손하지 않는 범위내에서 일부 자산, 부채 및 종업원을 제외한 경우 조세특례제한법시행령 제9조 제4항 에 규정된 사업양도로 볼 수 있는지

(질의 3) 사업양수도 전부터 사업부별로 구분경리를 하고 있다가 일부 사업부를 양도한 경우 연구 및 인력개발비의 발생액을 총발생액에서 양도한 사업부의 발생액을 차감한 금액으로 계산할 수 있는지

(질의 4) 조세특례제한법시행령 제9조 제4항 의 개정규정을 적용하지 않고 세액공제신청을 하였는 바, 결손 누적으로 세액공제를 적용받지 못한 경우 세액공제신청서를 지연하여 제출한 경우에도 재계산한 세액공제를 적용받을 수 있는지

2. 질의내용에 대한 자료

가. 관련 조세 법령 (법률, 시행령, 시행규칙, 기본통칙)

○ 조세특례제한법시행령 제9조

【연구 및 인력개발비에 대한 세액공제】

④ 제3항의 산식 중 당해 과세연도개시일부터 소급하여 4년간 발생한 연구 및 인력개발비의 합계액을 계산함에 있어서 합병법인, 분할신설법인, 분할합병의 상대방법인, 사업양수법인 또는 재정경제부령이 정하는 현물출자를 받은 법인(이하 이 항에서 󰡒합병법인 등󰡓이라 한다)의 경우에는 합병, 분할, 분할합병, 사업양도 또는 재정경제부령이 정하는 현물출자(이하 이 항에서 󰡒합병 등󰡓이라 한다)를 하기 전에 피합병법인, 분할법인, 사업양도인 또는 현물출자자(이하 이 항에서 󰡒피합병법인 등󰡓이라 한다)로부터 발생한 연구 및 인력개발비는 합병법인 등에서 발생한 것으로 본다. 다만, 피합병법인 등이 운영하던 사업의 일부를 승계한 때에는 피합병법인 등에서 합병 등을 하기 전에 발생한 연구 및 인력개발비에 각 사업연도의 승계사업의 매출액이 총매출액에서 차지하는 비율과 각 사업연도말 승계사업의 자산가액이 총자산가액에서 차지하는 비율 중 큰 것을 곱한 금액을 피합병법인 등에서 발생한 연구 및 인력개발비로 본다. (2000. 12. 29 개정)

【관련법령】

조세특례제한법 제10조 · 국세기본법 제45조 · 조세특례제한법 시행령 제9조

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