법인세법 시행규칙 제50조

법인이 제출한 감면·세액공제신청서에 기재된 소득금액과 관할세무서장 또는 관할지방국세청장이 결정·경정한 소득금액이 다른 경우, 감면 또는 세액공제의 기초가 될 소득금액은 결정·경정한 금액에 의한다. ‍​​‌​‌​​​‌​‌‌​​이는 법인세법 제59조의 감면·세액공제 규정을 적용할 때의 계산 기준으로, 법 제66조에 따른 결정·경정 소득금액을 신고액보다 우선한다. ‍​​‌‌‌​‌​​‌‌​​다만 「조세특례제한법」 제128조제2항 및 제3항이 적용되는 경우에는 그러하지 아니하다. ‍‌‌‌​​​‌​‌‌​​‌신고 소득과 세무서가 결정한 소득이 다를 때 어느 금액을 기준으로 세액공제를 계산하는지를 이 규정이 정한다.