리서치/예규질의회신

농어촌주택등 취득자에 대한 양도소득세 과세특례 해당 여부

부동산납세과-41 (2014. 1. 21.)

종류
예규
안건번호
부동산납세과-41
회신일
2014. 1. 21.
소관
국세청
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조세특례제한법 제99조의4 농어촌주택 과세특례에서 농어촌주택과 일반주택의 소재지 요건(같은 또는 연접한 읍·면·시 소재 여부) 충족 여부는 농어촌주택 취득 당시의 법령에 따라 판단한다. ‍​​‌​‌​​​‌​​‌​​시골집을 사고 원래 보유하던 도시 주택을 양도할 때 특례 적용 여부는 이 소재지 요건이 좌우하는데, 본 사안은 2008년 2월 통영시 A주택 보유 중 고성군 하일면 B주택을 취득한 경우이므로 2008.12.26. ‍​​‌​‌​​​‌​​​​개정 전 조문인 제99조의4제3항이 적용된다. ‍‌​​‌​‌​​‌‌‌‌​당시 규정은 일반주택과 농어촌주택이 같은 또는 연접한 '읍·면'에 소재하면 특례를 배제하였고(개정 후 '읍·면·시'로 확대됨), 따라서 소재지 요건은 취득 당시인 개정 전 조문을 기준으로 판단한다.

【요지】

「조세특례제한법」 제99조의4제3항에 따른 농어촌주택과 일반주택의 소재지 요건 충족 여부에 대해서는 농어촌주택 취득 당시 법령에 따라 판단하는 것임

【전문】

1. 질의내용 요약

○ 사실관계

- 1995.06. 경남 통영시 북신동 소재 A주택 취득

- 2008.02. 경남 고성군 하일면 소재 B농어촌주택(건물 123.97㎡, 대지 395㎡) 취득

- 2013.12. A주택 양도

※ 통영시와 고성군은 행정구역상 연접(해수면 연접 포함)함

○ 질의내용

A주택을 양도하는 경우 B농어촌주택을 「조세특례제한법」제99조의 4에 따른 농 어촌주택으로 보아 과세특례를 적용받을 수 있는 지 여부

2. 질의내용에 대한 자료

○ 조세특례제한법( 2008.12.26. 법 률 제9272호로 개정된 것) 제99조의 4

【농어촌주 택등 취득자에 대한 양도소득세 과세특례】

① 거주자 및 그 배우자가 구성하는 대통령령으로 정하는 1세대(이하 이 조에서 “1세대”라 한다)가 2003년 8월 1일(고향주택은 2009년 1월 1일)부터 2014년 12 월 31일까지의 기간(이하 이 조에서 “농어촌주택등취득기간”이라 한다) 중에 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 1채의 주택(이하 이 조에서 “농어촌주택등”이라 한다) 을 취득(자기가 건설하여 취득한 경우를 포함한다)하여 3년 이상 보유하고 그 농어촌 주택등 취득 전에 보유하던 다른 주택(이하 이 조에서 “일반주택”이라 한다)을 양 도하는 경우에는 그 농어촌주택등을 해당 1세대의 소유주택이 아닌 것으로 보아 「소득세법」 제89조 제1항 제3호 를 적용한다.

1. 다음 각 목의 요건을 모두 갖춘 주택(이 조에서 “농어촌주택”이라 한다)

가. 취득 당시 다음의 어느 하나에 해당하는 지역을 제외한 지역으로서 「지방자 치법」 제3조 제3항 및 제4항에 따른 읍 또는 면에 소재할 것

1) 수도권지역. 다만, 「접경지역 지원 특별법」 제2조 에 따른 접경지역 중 부동 산가격동향 등을 고려하여 대통령령으로 정하는 지역은 제외한다.

2) 「국토의 계획 및 이용에 관한 법률」 제6조 및 같은 법 제117조에 따른 도시지역 및 허가구역

3) 「소득세법」 제104조 의 2 제1항에 따른 지정지역

4) 그 밖에 관광단지 등 부동산가격안정이 필요하다고 인정되어 대통령령으로 정하는 지역

나. 대지면적이 660 제곱미터 이내이고, 주택의 면적이 대통령령으로 정하는 기준 이내일 것

다. 주택 및 이에 딸린 토지의 가액( 「소득세법」 제99조 에 따른 기준시가를 말한 다)의 합계액이 해당 주택의 취득 당시 2억원을 초과하지 아니할 것

2. 생략

② (삭제, 2007. 12. 31.)

③ 1세대가 취득한 농어촌주택등과 보유하고 있던 일반주택이 행정구역상 같은 읍ㆍ면ㆍ시 또는 연접한 읍ㆍ면ㆍ시 에 있는 경우에는 제1항을 적용하지 아니한다.

(이하 생략)

○ 조세특례제한법( 2008.12.26. 법 률 제9272호로 개정되기 전의 것) 제99조의 4

【농어촌주 택등 취득자에 대한 양도소득세 과세특례】

①․② 생략

③ 1세대가 취득한 농어촌주택과 보유하고 있던 일반주택이 행정구역상 같은 읍ㆍ면 또는 연접한 읍ㆍ면 에 소재하는 경우에는 제1항의 규정을 적용하지 아니한다.

(이하 생략)

○ 조세특례제한법( 2008.12.26. 법 률 제9272호로 개정된 것) 부칙

제1조(시행일) 이 법은 2009년 1월 1일부터 시행한다. 다만, 제85조의3, 제89조의2, 제91조의9, 제91조의10, 제100조의3, 제100조의5, 제100조의6, 제100조의11, 제132조, 제133조의 개정규정은 공포한 날부터 시행하고, 제74조제3항, 제87조의5제3항ㆍ제4항, 제88조의4제3항ㆍ제6항, 제89조제1항제1호, 제91조제1항 각 호 외의 부분(주식보유기간에 관한 개정부분은 제외한다), 같은 조 제3항 및 제5항부터 제7항까지, 제91조의2, 제91조의4제2항ㆍ제3항, 제91조의6, 제91조의8, 제100조의15, 제106조의3제1항제3호ㆍ제4항제2호ㆍ제7항, 제117조제1항제3호부 터 제6호까지, 같은 항 제10호ㆍ제18호, 제119조제6항ㆍ제7항, 제120조제4항제2호 및 제121조의5제5항제3호의 개정규정은 2009년 2월 4일부터 시행한다.

제22조(농어촌주택등 취득자에 대한 양도소득세 과세특례에 관한 적용례) 제99조의4의 개정규정은 이 법 시행 후 최초로 농어촌주택 또는 고향주택을 취득하는 분부터 적용한다.

○ 부동산거래관리과-439, 2012.08.17.

[ 회 신 ]

1세대가 취득한 농어촌주택등과 보유하고 있던 일반주택이 행정구역상 같은 읍·면·시 또는 연접한 읍·면·시에 소재하는 경우에는 「조세특례제한법」 제99조의4 제1항의 규정을 적용하지 아니하는 것입니다. 귀 질의의 경우 농어촌주택의 소재 지 요건은 「조세특례제한법」(2008.12.26. 법률 제9272호로 개정되기 전의 것) 제99조의4제3항에 따라 판단하는 것입니다.

[사실관계]

’98년 ’04년 ’10.7.1.

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일반주택 농어촌주택 행정구역 개편 일반주택

취득(창원시) 취득(고성군) ( 비연접⇒연접 ) 양도

- 1998년 경남 창원시(통합전) 소재 A아파트(일반주택) 취득

- 2004년 경남 고성군 고성읍 소재 B아파트(농어촌주택) 취득

* 창원시(통합전)와 고성군 연접하지 않음

- 2010.7.1. 마산시, 창원시, 진해시가 창원시로 통합

⇒ 창원시(통합후)와 고성군 연접함

- A아파트 양도 예정(재건축 전 또는 재건축이 끝난 후)

[질의내용]

- 농어촌주택( 조특법 §99조의4) 소재지 요건 충족 여부

→ 일반주택 소재지와 연접한 것으로 보아 특례가 배제되는지

○ 부동산거래관리과-101, 2010.01.20.

「조세특례제한법」 제69조 의 자경농지에 대한 양도소득세 감면 규정을 적용함에 있어 같은 법 시행령 제66조제1항제2호에서 규정하는 연접한 시ㆍ군ㆍ구(자치구 인 구를 말함)라 함은 행정구역상 동일한 경계선을 사이에 두고 서로 붙어있는 시ㆍ군ㆍ구를 말하는 것 으로서, 여기에는 해상에서 동일한 경계선을 사이에 두고 있는 경우도 포함 되는 것입니다.

【관련법령】

조세특례제한법 제99조의4 · 조세특례제한법 제69조 · 소득세법 제89조 · 소득세법 제104조의2

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