매입임대주택으로 등록한 날부터 10년 이상 계속 임대한 경우 조특법§97의5 적용 여부
사전-2026-법규재산-0211[법규과-823] (2026. 4. 2.)
- 종류
- 예규
- 안건번호
- 사전-2026-법규재산-0211[법규과-823]
- 회신일
- 2026. 4. 2.
- 소관
- 국세청
주택 취득일로부터 3개월이 지난 뒤 매입임대주택을 장기일반민간임대주택으로 변경등록한 경우에는 조특법 제97조의5의 양도소득세 100% 감면특례를 적용받을 수 없다. 이 감면은 제97조의5제1항제1호가 민간매입임대주택을 취득하고 취득일부터 3개월 이내에 장기일반민간임대주택등으로 등록할 것을 요건으로 정하고 있기 때문이다. 질의 사안은 2015.5.29. 다세대주택을 취득해 구 임대주택법상 매입임대주택으로 등록한 뒤 2018.9.4.에야 장기일반민간임대주택으로 전환등록하여, 취득 3개월 지나 임대등록한 결과 3개월 이내 등록요건을 충족하지 못하였다. 따라서 매입임대 등록일부터 10년 이상 계속 임대하였더라도 감면 대상이 아니다.
【요지】
주택 취득일로부터 3개월이 경과된 후 매입임대주택을 장기일반민간임대주택으로 변경등록한 경우 조특법§97의5의 감면특례 적용불가함
【전문】
1. 사실관계
○ 2015.05.29. 서울시 소재 다세대주택 9호 (전용면적 85㎡ 이하) 취득
- 2015.5월 舊「임대주택법」에 따른 매입임대주택으로 등록하고 세 무서에 사업자등록을 함
○ 2018.09.04. 매입임대주택을 장기일반민간임대주택 * 으로 등록 변경
* 「민간임대주택에 관한 특별법」 제2조제5호
○ 2025.12.29. 「민간임대주택에 관한 특별법」에 따른 임대등록 말소
○ 2025.12월 다세대주택 9호 중 3호 양도
- 조특법§97의5①(3)의 요건을 충족한 것으로 전제함
2. 질의요지
○ 다세대주택을 민간임대주택법 (舊임대주택법) 에 따라 매입임대주택으로 등록한 후 주택 취득일로부터 3개월이 지나 장기일반민간임대주 택으로 변경등록한 경우로서
- 매입임대주택 등록일로부터 10년 이상 계속하여 임대한 후 양도하는 경우 조특법§97의5에 따른 감면특례를 적용받을 수 있는지 여부
3. 관련 법령
□ 조세특례제한법 제97조의5
【장기일반민간임대주택등에 대한 양도소득세 감면】
① 거주자가 다음 각 호의 요건을 모두 갖춘 「민간임대주택에 관한 특별법」제2조제4호에 따른 공공지원민간임대주택 또는 같은 법 제2조제5호에 따른 장기일반민간임대주택 (이하 이 조에서 “장기일반 민간임대주택등”이라 한다) 을 양도하는 경우에는 대통령령으로 정하는 바에 따라 임대기간 중 발생한 양도소득에 대한 양도소득세의 100분의 100에 상당하는 세액을 감면한다.
1. 2018년 12월 31일까지 「민간임대주택에 관한 특별법」제2조제3호의 민간매입임대주택 및 「공공주택 특별법」제2조제1호의3에 따른 공공매입임대주택을 취득 (2018년 12월 31일까지 매매계약을 체결하고 계약금을 납부한 경우를 포함한다) 하고, 취득일로부터 3개월 이내에 「 민간임대주택에 관한 특별법」에 따라 장기일반민간임대주택등으로 등록할 것
2. 장기일반민간임대주택등으로 등록 후 10년 이상 계속하여 장기일반민간임대주택등으로 임대한 후 양도할 것
3. 임대기간 중 제97조의3제1항제2호의 요건을 준수할 것
② 제1항에 따른 세액감면은 제97조의3의 장기일반민간임대주택등에 대한 양도소득세의 과세특례 및 제97조의4의 장기임대주택에 대한 양도소득세의 과세특례와 중복하여 적용하지 아니한다.
③ 제1항에 따라 세액감면을 적용받으려는 자는 대통령령으로 정하는 바에 따라 주택임대에 관한 사항을 신고하고 과세특례 적용의 신청을 하여야 한다.
④ 제1항에 따른 임대주택에 대한 임대기간의 계산과 그 밖에 필요한 사항은 대통령령으로 정한다.
□ 조세특례제한법 시행령 제97조의5
【장기일반민간임대주택등에 대한 양도소득세 감면】
① 법 제97조의5제1항제2호에 따른 10년 이상 계속하여 「민간임대 주 택에 관한 특별법」제2조제4호의 공공지원민간임대주택 또는 같은 조 제5호에 따른 장기일반민간임대주택 (이하 이 조에서 “장기일반민간임대 주택등”이라 한다) 으로 임대한 경우는 장기일반민간임대주택등으로 10년 이상 계속하여 등록하고, 그 등록한 기간 동안 계속하여 10년 이상 임대한 경우로 한다. 이 경우 다음 각 호의 경우에는 해당 기간 동안 계속하여 임대한 것으로 본다.
1. 기존 임차인의 퇴거일부터 다음 임차인의 주민등록을 이전하는 날까지의 기간으로서 6개월 이내의 기간
2. 제72조제2항 각 호의 법률에 따라 협의매수 또는 수용되어 임대할 수 없는 경우의 해당 기간
3. 「도시 및 주거환경정비법」에 따른 재개발사업ㆍ재건축사업, 「빈집 및 소규모주택 정비에 관한 특례법」에 따른 소규모주택정비사업 또는 「주택법」에 따른 리모델링의 사유로 임대할 수 없는 경우에는 해당 주택의 관리처분계획 인가일 (소규모주택정비사업의 경우에는 사업 시행계획 인가일, 리모델링의 경우에는 허가일 또는 사업계획승인일을 말한다) 전 6개월부터 준공일 후 6개월까지의 기간
② 법 제97조의5제1항을 적용할 때 임대기간 중 발생한 양도소득은 다음 계산식에 따라 계산한 금액으로 한다. 이 경우 새로운 기준시가가 고시되기 전에 취득 또는 양도하거나 제1항에 따른 임대기간의 마지막 날이 도래하는 경우에는 직전의 기준시가를 적용하여 계산한다.
소득법§95①에 따른 양도소득금액
×
임대기간 마지막 날의 기준시가
-
취득 당시 기준시가
양도 당시 기준시가
-
취득 당시 기준시가
③ 장기일반민간임대주택등의 임대기간의 계산에 관하여는 제97조제5항 제1호 및 제3호를 준용한다. 이 경우 「소득세법」제168조에 따른 사업자등록과 「민간임대주택에 관한 특별법」제5조에 따른 임대 사 업자등록을 하고 장기일반민간임대주택등으로 등록하여 임대하는 날부터 임대를 개시한 것으로 본다.
④ (생 략)
□ 조세특례제한법 시행령 제97조
【장기임대주택에 대한 양도소득세의 감면】
⑤ 법 제97조제4항의 규정에 의한 임대주택에 대한 임대기간 (이하 이 조에서 “주택임대기간”이라 한다) 의 계산은 다음 각호에 의한다. <개정 2000.1.10, 2001.12.31., 2008.2.29>
1. 주택임대기간의 기산일은 주택의 임대를 개시한 날로 할 것
2. 삭제 <2001.12.31>
3. 상속인이 상속으로 인하여 피상속인의 임대주택을 취득하여 임 대하는 경우에는 피상속인의 주택임대기간을 상속인의 주택임대 기간에 합산할 것
4. 5호 미만의 주택을 임대한 기간은 주택임대기간으로 보지 아니할 것
5. 제1호 또는 제3호의 규정을 적용함에 있어서 기획재정부령이 정 하는 기간은 이를 주택임대기간에 산입할 것
【관련법령】
소득세법 제95조 · 조세특례제한법 제97조의5 · 조세특례제한법 시행령 제97조의5
관련 문서
매입임대주택을 장기일반민간임대주택으로 등록 변경 시 장기보유특별공제 적용방법
매입임대주택을 장기일반민간임대주택으로 변경 시 장기보유특별공제 임대기간 계산 기준
1주택을 보유하고 있는 자가 조정대상지역으로 지정되지 않은 다른 주택을 계약했을 때 합산배제 가능 여부
조정대상지역 지정 전 계약한 주택도 장기임대 시 종합부동산세 합산배제 가능
1주택을 보유한 상태에서 새로 취득한 조정대상지역에 있는 아파트가 합산배제되는지
조정대상지역 지정 전 주택 취득·계약금 지급분은 종합부동산세 합산배제 가능하나 20.7.11 이후 등록 아파트는 제외
2018.9.14. 이후 별도 세대원에게 조정대상지역 내 주택을 증여한 경우 합산배제 여부
2018.9.14 이후 조정대상지역 장기일반민간임대주택을 별도세대 자녀에게 증여 시 합산배제 임대주택 대상 아님
2018.9.14. 이후 취득한 조정대상지역 내 공공지원민간임대주택의 합산배제 여부
1주택 이상 보유자가 조정대상지역서 취득한 공공지원민간임대주택도 종합부동산세 합산배제